Genomic Feature

fr105

ID
ZDB-ALT-220502-1
Name
fr105
Synonyms
None
Affected Genomic Region
Construct
None
Type
Allele with one deletion (1)
Protocol
embryos treated with
Lab of Origin
Boehm Lab
Current Source
Other Pages
Notes
No data available
Genome Browser
Variants
Variant Type
Small Deletion
Variant Location
Chr 13: 15962388 - 15966005 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change
CTCAGATGCAGGCATGTCCTCCCTCTGCTCATTCTGGCTGTTCTCTTCCTTCACTATGGAAAGCAAGACAAAGAAACCACGCATAAGTTTTAGATTGCTGTATCTAACCTAAACTCATCTTCTGGCATGGTGCTAACTATGAGGAAGGATGTTTCATGCAATATGATGTTGCACACATTGCTATATGGTTTTCTGTCTCTTACTTTAGTTTTGTCCCTATAGTTTTCTCCTCATCTTGAGAATTGTTTTCTTAAGCTTTGAGTCTTTAAAGGCTTATACTGTAGCTATGGGTTATTTGATATAGGGTTATCTGTCACCTGATAGAGAACTGCCATTGCATTGTTGGTGGAAGTTGTATATCTACTTTTATACAACAGATACAGGGATAGTTCACCCAAAAAAGACAATTGCTGCTAATTTGATGGTGAAGATGCCATTTAGAAGATGGTGACTATTTTCCAGTAAATTATTTTAAAATTTATTATGAATTCAATGTCAATCAGCACTTTGACAGTAAAAAACATTAAAAAAATGAATACCCTAATGGCTCCTGGTGATACATAATAAAAGAAACAAAATGAACCTATGCAAGAAATTTAACAGTATTTAAAACATTAACACCTCTAATCCAGAGCTTTGGCAGACAGTCTCAAGCATGCTCAGAAAGTGTGAATTCCTTCAGCTGATTTGAATGTTATCACTCGATTGAATGGGTGTGGTTATCAGTGTTTATCAGCTGATAGATATGGGCCAGTAGGGACCATCTGCACCTACTGTAGGTTTAGAAGGCTGTTATCATCCATCCACTTGGTTAATCAACTACAGATCACATACAGCTGCGGCTGGCAGTTAATGGGAATTATTTAAATCCTTTCTTAAATTTCTCATTAAGTGTATTTCATTAACTTCTATCCCTACCCCTAAACCCTAAACCCAACCGTCACAGTAATGTAAAAACAGATCCGGATCTGAAGTCTTCTCTATTAGTATAGCTGATTAACCATGATAATTATTTATATTATTCATTTAGTTTCCCATTAATTGTATTTTATTAACGTCAACCCCTACCCCAACCCTGAACCCAACCGTCACAGTAATGTAAAAACAGATCTGGATCTGGAGTCTTCTTTACTAATATAGCTGATTAACCATGATAGTGACAAAGGGTAACACTTTATGATGTATTAATATGTAAACTCAACATTATTTTGAATGAATGATGGATTATGGCACGCACTAATCATGAACTAATTTTAACTACAACCTGAGTCACAAGAGTTCATGTGTGAGTAGCGGCTATACCTTTATTACTTGTTAATACATATTGTTAATTGATGTATTAATTAACATTAAAGTTTAAGCTGAATATAACCATTTTGAACTTATGAGCTGTTAATGTATAATTACGTCATGACCTTACTTAGAGGGGCACATCACCATTAACTCCTGTGCACTTTTATATTGTTATCCAATGTAAATGCAGTACAGACGTGCATAAGGAGTTCGTGAATAGTTAAGAATGGATTACTGATGATGTGCCCCTTCAAGTAAAGTCATGCTATAATTATACATTAACATCATGAGTTCATAATGGTTAATTTAAGCATAAACTAATACATGAATTAACAAACAAGCATGCACCAACATGTATTAACATGTAATTAACTTTAAAAATTAGTTAAAGTTCGTTCATGATTAGCTCATGCATTAACTGATTAGTTCAAAGTAATGTATAGTTTACATATCAACAAATTACTCATGTACCTTAACACTTTATAATAACTACACACTCTAAATCATCTATAAAGCATTAGCAAATAGTTAATTCAATATATCTTATGCATTAACTCTAAATTAACAGACGTTAGTAAGCAGTTTATAAATACAGCTACAAATGCTGTATTTTTGACATAAGCACATTTATAATGAGCTTAATAATTGTGTTTTCATACGTAGTTACTTATTAATTGTTTATTACTAAATTCAATATTGCATTATTTACAAACCATTTGTATTAAACAGTAGTTAGGCTTTTAGAATCATTCAGAAAGAGTTATTAAATGTTGTTAAGCCAAACAGAGAGTTAATAAAAGTTAATAAACCAAACAAATCAACATGTTATTATTCAGGCAAATAGTAATGGTTACTATGTATCTTAATAAATGCTTTATTAAAAAAAAAAGGCTTAGTATTGAATGAACAATAAATGTTTGCAATCTTATCTAAACAGTAAAATTGCTGTAAACTTTAAATATTGCCGAATAACAGGAGTGTCAAAATACAACTAACAGAAATTACAATTAAATAAAATTGAATAAATCAACAACAATATAATAAATTAATAATATATTATGATACAACATTTCAAAGTTATTTAGCAATGTACAGTGATTTTATTTTCACATTATATTGCAAAGATTTATTTTTATTTGATACAGTTTCATTTATGTATCTTCAAAAGAATAGAAATTAAAAAAGTGTTTTGGTAATACTTTATAATAACCACACATTATGAATCATTTATTAAGCATGAGCAAATAGTTAGTTCATTATCTGTTAAGCATTAACTCTACATTAATAAATGTGAGTTAGCAGTTTATAACTGCAGATACAAATGCTGTATTCTTGACAAAAACACATATATAGTGTGCCTGATTGTATTTTCATTCATTCATATTTTGCCACTCTTGTTATTCTTATGTTTAAACTTTACAGTACTTTTACTTTGTTATAAGATTGAAAAGATGTATTGTCCATTTAATACTAAGACTTTAATTGTGGGTTTTTTTCAGCAGTTTTACCTTTGGGTGAACTTTCCCTTTAAACCAGGGGTCACCAATCTCGGTCCTGGAGGGCCGGTGACCCTGCAGGTTTTAGCTCCAACTTGCCTCAACACACCTGCCTGGATGTTTAAAGTATACCTAGTAAGATCTTGATTAGCTTGTTCAGTTGTGGTTGATTAGAGTTGGAGCCAAAATCTGCAAGACACCAGCCCTCCAGGAACAAGTTTGGTGACCCTTGATTTAAACCAGGGGTGTCCAAACTTGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCTGGAGAGTTTATCTCCAGCTTGCTTCAACACACCTGCCAGGAAGTTTCTCATATATCTAGTAAGAGCTTGATTATCTGTTTCAGGTGTGTTTGATTAGGGTTGGAGCTAAACTCTCCAGGACACCGGCCCTTCAGGACCGAGTTTGGACACCACGGATTTAAACCAACACATAGAAATATCATTCATTCACAGACCTGTATAAATGCTGTTCTGAAGGCCCATGCACTGCAAGTAGTTGTGACATCTCTCCTTATGTTCCTCCAGTGAGCTCCGCTGCTTGTAACTGCGTCCGCAATATGCACACTTATGGGGCTTTCCAACTGACAGGTCGAAATAGAAACAAAATCTGCTCAGTCAGACCACATCATTTAGTTGTTGTTTTAATACAATAAAGAGTTTCAAAATATTCCATCATGAGTTACCCGAATGAGTGCGCAGATGTCCAGTGAGAGCGTCTCTGCGGCGGCAAGCATAGTTGCACAGGTGACATTTGAAAGGTTTCTCGCCAGAGTGAAGTTTGATGTGTCGGAGCAGGTTACCCTTCTGAGTG/-
Variant Notes
None
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
DNA/cDNA Change
3618 bp deleted (1)
Transcript Consequence
Premature Stop (1)
Protein Consequence
None
Sequences
Flanking Sequence
ACAGCAATGGGCTTACACTCATTACGTATGAGAACCATTATTAGTAACCCAAAGAACCTTTTAGTGAAAAAAATAAATAAAAATCTTAAAATATTGATGTTTGTTTATGCAAAGCACATTTTAAAAGCCTCTTTTTACATTTTTGGAATGGTTCACCAGCTATACTGTAGCTGTTAAATAAGCAATAGAAATTTAATAATCTTGTAAGAAACTAGCAACGTGAAATTCCTATCGCAAGCCATAATGATCATCTTTTTGCTTTTTAAAGTAAACTCATCCAAGAAAAAGAAATGATGTAGCTTCCTATCATTATTAAGTATTTCTTTAAGTCAGATACATACTGTAAATGCATATTAAACAGTGATCGCTGGATTATCTAACATCTATAATATATTGCTGCACAATGAAAGCAAACTTCAACTCTTACCCACAAACCTCTGTGGCATAGAGCTCTTACGCTTAGCTACATTGTTAGCTATCCTGTCTAGCACCAAGGCCCT
CTCAGATGCAGGCATGTCCTCCCTCTGCTCATTCTGGCTGTTCTCTTCCTTCACTATGGAAAGCAAGACAAAGAAACCACGCATAAGTTTTAGATTGCTGTATCTAACCTAAACTCATCTTCTGGCATGGTGCTAACTATGAGGAAGGATGTTTCATGCAATATGATGTTGCACACATTGCTATATGGTTTTCTGTCTCTTACTTTAGTTTTGTCCCTATAGTTTTCTCCTCATCTTGAGAATTGTTTTCTTAAGCTTTGAGTCTTTAAAGGCTTATACTGTAGCTATGGGTTATTTGATATAGGGTTATCTGTCACCTGATAGAGAACTGCCATTGCATTGTTGGTGGAAGTTGTATATCTACTTTTATACAACAGATACAGGGATAGTTCACCCAAAAAAGACAATTGCTGCTAATTTGATGGTGAAGATGCCATTTAGAAGATGGTGACTATTTTCCAGTAAATTATTTTAAAATTTATTATGAATTCAATGTCAATCAGCACTTTGACAGTAAAAAACATTAAAAAAATGAATACCCTAATGGCTCCTGGTGATACATAATAAAAGAAACAAAATGAACCTATGCAAGAAATTTAACAGTATTTAAAACATTAACACCTCTAATCCAGAGCTTTGGCAGACAGTCTCAAGCATGCTCAGAAAGTGTGAATTCCTTCAGCTGATTTGAATGTTATCACTCGATTGAATGGGTGTGGTTATCAGTGTTTATCAGCTGATAGATATGGGCCAGTAGGGACCATCTGCACCTACTGTAGGTTTAGAAGGCTGTTATCATCCATCCACTTGGTTAATCAACTACAGATCACATACAGCTGCGGCTGGCAGTTAATGGGAATTATTTAAATCCTTTCTTAAATTTCTCATTAAGTGTATTTCATTAACTTCTATCCCTACCCCTAAACCCTAAACCCAACCGTCACAGTAATGTAAAAACAGATCCGGATCTGAAGTCTTCTCTATTAGTATAGCTGATTAACCATGATAATTATTTATATTATTCATTTAGTTTCCCATTAATTGTATTTTATTAACGTCAACCCCTACCCCAACCCTGAACCCAACCGTCACAGTAATGTAAAAACAGATCTGGATCTGGAGTCTTCTTTACTAATATAGCTGATTAACCATGATAGTGACAAAGGGTAACACTTTATGATGTATTAATATGTAAACTCAACATTATTTTGAATGAATGATGGATTATGGCACGCACTAATCATGAACTAATTTTAACTACAACCTGAGTCACAAGAGTTCATGTGTGAGTAGCGGCTATACCTTTATTACTTGTTAATACATATTGTTAATTGATGTATTAATTAACATTAAAGTTTAAGCTGAATATAACCATTTTGAACTTATGAGCTGTTAATGTATAATTACGTCATGACCTTACTTAGAGGGGCACATCACCATTAACTCCTGTGCACTTTTATATTGTTATCCAATGTAAATGCAGTACAGACGTGCATAAGGAGTTCGTGAATAGTTAAGAATGGATTACTGATGATGTGCCCCTTCAAGTAAAGTCATGCTATAATTATACATTAACATCATGAGTTCATAATGGTTAATTTAAGCATAAACTAATACATGAATTAACAAACAAGCATGCACCAACATGTATTAACATGTAATTAACTTTAAAAATTAGTTAAAGTTCGTTCATGATTAGCTCATGCATTAACTGATTAGTTCAAAGTAATGTATAGTTTACATATCAACAAATTACTCATGTACCTTAACACTTTATAATAACTACACACTCTAAATCATCTATAAAGCATTAGCAAATAGTTAATTCAATATATCTTATGCATTAACTCTAAATTAACAGACGTTAGTAAGCAGTTTATAAATACAGCTACAAATGCTGTATTTTTGACATAAGCACATTTATAATGAGCTTAATAATTGTGTTTTCATACGTAGTTACTTATTAATTGTTTATTACTAAATTCAATATTGCATTATTTACAAACCATTTGTATTAAACAGTAGTTAGGCTTTTAGAATCATTCAGAAAGAGTTATTAAATGTTGTTAAGCCAAACAGAGAGTTAATAAAAGTTAATAAACCAAACAAATCAACATGTTATTATTCAGGCAAATAGTAATGGTTACTATGTATCTTAATAAATGCTTTATTAAAAAAAAAAGGCTTAGTATTGAATGAACAATAAATGTTTGCAATCTTATCTAAACAGTAAAATTGCTGTAAACTTTAAATATTGCCGAATAACAGGAGTGTCAAAATACAACTAACAGAAATTACAATTAAATAAAATTGAATAAATCAACAACAATATAATAAATTAATAATATATTATGATACAACATTTCAAAGTTATTTAGCAATGTACAGTGATTTTATTTTCACATTATATTGCAAAGATTTATTTTTATTTGATACAGTTTCATTTATGTATCTTCAAAAGAATAGAAATTAAAAAAGTGTTTTGGTAATACTTTATAATAACCACACATTATGAATCATTTATTAAGCATGAGCAAATAGTTAGTTCATTATCTGTTAAGCATTAACTCTACATTAATAAATGTGAGTTAGCAGTTTATAACTGCAGATACAAATGCTGTATTCTTGACAAAAACACATATATAGTGTGCCTGATTGTATTTTCATTCATTCATATTTTGCCACTCTTGTTATTCTTATGTTTAAACTTTACAGTACTTTTACTTTGTTATAAGATTGAAAAGATGTATTGTCCATTTAATACTAAGACTTTAATTGTGGGTTTTTTTCAGCAGTTTTACCTTTGGGTGAACTTTCCCTTTAAACCAGGGGTCACCAATCTCGGTCCTGGAGGGCCGGTGACCCTGCAGGTTTTAGCTCCAACTTGCCTCAACACACCTGCCTGGATGTTTAAAGTATACCTAGTAAGATCTTGATTAGCTTGTTCAGTTGTGGTTGATTAGAGTTGGAGCCAAAATCTGCAAGACACCAGCCCTCCAGGAACAAGTTTGGTGACCCTTGATTTAAACCAGGGGTGTCCAAACTTGGTCCTGGAGGGCCGGTGTCCTGGAGAGTTTATCTCCAGCTTGCTTCAACACACCTGCCAGGAAGTTTCTCATATATCTAGTAAGAGCTTGATTATCTGTTTCAGGTGTGTTTGATTAGGGTTGGAGCTAAACTCTCCAGGACACCGGCCCTTCAGGACCGAGTTTGGACACCACGGATTTAAACCAACACATAGAAATATCATTCATTCACAGACCTGTATAAATGCTGTTCTGAAGGCCCATGCACTGCAAGTAGTTGTGACATCTCTCCTTATGTTCCTCCAGTGAGCTCCGCTGCTTGTAACTGCGTCCGCAATATGCACACTTATGGGGCTTTCCAACTGACAGGTCGAAATAGAAACAAAATCTGCTCAGTCAGACCACATCATTTAGTTGTTGTTTTAATACAATAAAGAGTTTCAAAATATTCCATCATGAGTTACCCGAATGAGTGCGCAGATGTCCAGTGAGAGCGTCTCTGCGGCGGCAAGCATAGTTGCACAGGTGACATTTGAAAGGTTTCTCGCCAGAGTGAAGTTTGATGTGTCGGAGCAGGTTACCCTTCTGAGTG/- AATGAAGCACCACATTGATTGCACTGGAATGGCCTTTCACCTATGTGACAAATAACGATAACACATTACTTATGCACTCC  ...
Additional Sequence
None
Fish
Supplemental Information
Genotyping protocol
None
Citations
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