Genomic Feature
sfc19
Notes
No data available
Variants
- Variant Type
- Insertion
- Variant Location
- Chr 17: 2003798 - 2003799 (GRCz11) (1) Details
- Nucleotide change
- -/TAAGCGGCTTC
- Variant Notes
-
Inserted amino acids are GSRL followed by the premature stop codon.
Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)
- DNA/cDNA Change
- 11 bp inserted (1)
- Transcript Consequence
- Frameshift, Premature Stop (1)
- Protein Consequence
- Amino Acid Insertion: 4 AA added (1)
- Flanking Sequence
-
GCAGATATACTGAATAAAACAGCAGGGGGCAGCTATAGAACAGCTGGAGTAGCAGCGCTGCCTTGTAAACGAAGCAATGTGATGTCAAATCCAGCAAGATTTGATCAATTCCATTAACTCCACAGCATTACAATGTTCAGTGATTAAATTTAGGCAAGCTTCAGAATATAACCATACATTGTATAATAATTTAATACCCTGTAAAATAACATTTAATACTTTTCAAAGGGCCTTAAAATTCTCTAAATTAATTAAACATTTTAAGACCCCGCAGACAGTGAAGTAGTAGTTCGTGAGCCCTTTAAACACTAATAACACTCATTTAAGAGGCAACAGTAGAAGAAAACCCACCGGTGACTCCGCTGCAGAACGTCATGCAGCCGGCCTCAGTTTCAAAGCGGTTTTGATTTCCTTCACAGCCGCCGTAGTTAAAGCGGTAACAGAGACGCTTGTTTGGATTGTAATACCATTTGGTTTGACTGCCGGGACAGGTTCCTGTTA
-/TAAGCGGCTTC CTGGCGGCTTCACACAGCGAGCTGGAGAGCGCAGAAAACAGATTAATTGCATTAATGTAGTCATTTATTAAAACAATGTCAGCAAAAATGCAATATTTAAGATGGTAAACTAATATATTTACAGTTTAAGATTAGTACAATTAAATAATATCCAAGTATTATAACTAATATACCAATGCATTAATATGACTGTTATTATACCATTTTATTTAAATGAAGCATTAAAATGAGCTTAAACTGGATTCATTTTTAGATTATTACAAGAAAAAAATTTTTAGATTACCATATTAATTGTTAAATTTAGTGTAAATACAAGCTCTAACCCTAGATCAACTTTTATTAAATTAGAATACGTTGATTAAATTTAAGATTAACATGAGGCAAATATGTTATATGTTGATTAAATTTAGGTTAAATCTAATATGAAAGAAAAAAATTTACTAAATGATTTTAAAAATATATATTAAATTAGATCCAACTTGAGATTAACATGCTTAATGT - Additional Sequence
- None
Fish
Supplemental Information
- Genotyping protocol
- None