Transcript

atg16l1-202

ID
ZDB-TSCRIPT-120702-4
Name
atg16l1-202 Nomenclature History
Previous Names
  • atg16l1-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
ENSDART00000157459 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|ENSDART00000157459.2|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000099430.2 transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:atg16l1 cdna chromosome:GRCz11:15:45591669:45637460:1
TAGAGCCAAAATGGCGTCCGTGATCCTTCAGTCTGGTGTG
GGCTAGCATGAAACCTACCCGATTTACCCTGAAATGACAC
ATTTCTGCTGTTATTAGTCGGATTACTCAATTCTATCATC
AAAAAGAATCGGCGTTATCCTCAAGAGGACGCGTTTTGAT
GCTGTGAGGAGGAGATGGCGGGACGCAGAGTGGAGTGTTT
GTGGAAGCGTCACGTTGTGGAGCAGCTGAAGCAGAGAGAC
AGAGTACAGCGTCAGGCCTTTGAGGAGATCATACACCAAT
ATAACCGGCTGTTGGAGAAGTCTGATCTTCAGGTTGTTTT
TTCTGAACGTCTCCAAACTGAGAAATATGAGCAACAGAAC
AGACACGACCTCAGTCCGTGTGTGGACGGCGGGCGCAGTG
ATTCTCTGCAGCAGGAAATGTCTCAGATGCGGATCAGACA
TCAGGAAGAGCTGACGGAGCTCCACAAGAAAAGAGGAGAG
CTGGCCCAGAGTGTGATTGAATTAAACAACCAGATCCAGC
AGAAAGACAAAGAGATCCAGAGTAACGAAGTCAAGATGCA
GGAGTATCTGCAGCAGATCTCGCAGCTGGAAGGAGAGTGT
CGTGAGCTCAGGAACTGTCTGGCGGATTTGGAACGAGCCA
ATCAGACGCTGCGAGACGAGTACGACGCCCTGCAGATCAC
GTTCAGCGCTCTGGAGGAGAAACTGCGCAAAACCACCGAG
GACAATCAGGAGCTGGTGACGCGCTGGATGGCGGAGAAAG
CCCAGGAGGCCAACAGACTCAATGCTGAGAACGAGAAGGA
CTCCAGACGCAGGCAGGCAAAGCTGCAGAAGGAACTGGCA
GATGCAGCAAAGGAGCCGCTTCCTATCGACCCAGATGATG
ACATCGAGGTTCTCACAGAGGATGCTGGGAAGGCAACGGG
TGAAACGTCACCGAGCAGACAGCTCAGTCGCACACCCAGT
AAACGGTTGTCTCAGCCCCCTCCTCCCGCAGGACTGCTGG
ACTCCATCTCTAATATGTTTGGAAGACGTCGCTCCGTGAA
TTCGTTCAGCTCGTCTCCTGAAAACGCAGAAGTGCCGTCG
GCGTGTGCGGATGTGCGTGTTCCCTCCACTGCACTCCACA
TCTTTGACGCTCATGATGGAGAAGTGAACGCTGTGAGGTT
TAGTCCTGGTTCTCGTCTGCTCGCCACAGGAGGAATGGAC
CGCCGGGTCAAACTCTGGGAAGTCGTATCTGGGCGATGTG
AACCTAAAGGTGCACTGACGGGAAGTAATGCTGGAATCAC
CAGTATAGAGTTTGACAGTGCGGGCTCGTATCTTCTGGCT
GCTTCCAATGATTTCGCAAGCCGAATTTGGACTGTCGATG
ACTACAGACTGAGGCACACGCTCACAGGACACAGCGGGAA
GGTTTTATCTGCTCGCTTTCTCCTGGATAACGCAAGGATC
GTTTCCGGCAGCTACGACCGAACGCTCAAACTCTGGGACC
TGCGCAGCAAAGTCTGCATGAAGACGGTGTTTGCTGGTTC
CAGCTGTAATGATATCGTCTGCACGGAGCAGTGTGTGATG
AGCGGACACTTCGATAAGAAAGTTCGCTTCTGGGACATCA
GGGCAGAGAGTATCGTGCGTGAGCTGGAGCTGATGGGCCG
TGTGACGTCTCTGGATCTGAATCACGACCGCACTGAACTC
CTCACCTGCTCTCGGGATGACCTGGTGAAAATCATCGACC
TGCGCACTAATGCTGTCCGACAAACCTTTAATGCTCAAGG
CTTCAAGTGCGGTTCTGACTTCACCAGGGTCACGTTTAGT
CCTGACGGGAGTTTTGTGGCGGCCGGTTCTGCAGACGGCG
TTCTGTACCTCTGGAACGTTCTGACAGGGAAACTAGAGAA
AACCCTCGATAAGGGTCACAGTTCTGCTATCAACTCGGTG
TCCTGGTCTCTGTCGGGAGCGTTTGTGGCCAGTGTGGAGA
AAGGCAGCAAGGCCGTGCTTTGGTCCGACATGTGATCCTC
CGCCGTGATTGGCTAAACATGGCACCGCCCTGCCGTGATT
GGATGAAACAGACTGTAAAGACGGAACGAAAGTGAGCCCA
CCCTCACGCCCCACAGGCCTCTAAAACTACCTTTCCCACA
ATGCCATCTGTCTGGCTCTCTACACATACTATACTATACA
TATTTATAGCAGCTTTCATGCACAGTCTCGTGTCTCACAC
ACACACACACACACACACACACATGCATTCAGTGCGAGAT
TACACAAAAGACTCTCGTTGATCTTTGACTCTTACTGCTT
ATTTTAACACAGCTTTAAATCAGTGTGTGTGTGTTTACTG
TTGTAGTTCATGCTTTGCCTTATACAGATACAGGCCATTA
AGGTGTGTGTGTGTGTGTACGTTTGTGTGCGTGCGTTTGC
GAGTGCGTGCGTGCATGAGTGCATTTGCGTTGGTATGTGC
GTGCGTTTGCGAACGTCGTTGCGTTTGTGTGCGTGCATTT
GTGTATGCGCGCACGTTTGCATGCGTGCATCTGAGTGCGT
GTGTTTGCGTACGTTTATGCGTGTGTGCATTTGCGCGTGT
GTATGTGCGTTTGCGTGCGTGAGTGCGTTTGCGTACGTGC
GTGTTTGTGTGCTCGTGTTTGCATGCAGACACGAGCACAC
AAACACATGCATGTGCGTTTGCGTATGTATGTGCGTGTGT
TTACGTACATGTGTGCGTTTGCTTACGTGCGTTTACGTAC
ATATGTGCATTTGTTTCCATACATGCGTGTTTGTGTGTGC
GTTCGTGTACGTGCATGTGTTTGAGTGTGTGCATTTACGT
ACGTGTGTGCGTGCTTTTGCGCATGTGTTTGTGCGTGCGT
TTGCATACGTATGTGCGTGTGTTTACGTACATGTGTGCGT
TTGCTTACGTGCGTTTACGTACATATGTGCATTTGTTTCC
ATACATGCGTGTTTGTGTGTGCGTTCGTGTACGTGCATGT
GTTTGAGTGCGTGCATTTGCGTACGTGCGTGTGTGCGTTT
GCGTACGTGCGTGTGTTTGTGTGCGTGCGTGTGTTTGTGT
GCGTGCGTGCGTTTGTGTACGTGTGTGCGTTTGCATACGT
GCGCGTGTTTGCGTACGTTCGTTTATGTGCATCTCTGTGT
GCGTTTGTGTGCGCGTGCATTTGCTTGTGTGCATGCATTT
GTGTGCTCGTGTGTCTGTGTGTGTGCGTGTGTGTATGTTC
ATTAAAGTAATTCCAGCATTGTTAACACAAAATAATGTCA
GGTTGCTGAAAATCGTCCTGTTAAGGGTTAAAAAGTATCC
CAATTGTCTATAGCAACTTACATTTGCTCGGAAAGGATCT
TAAAAATCAAAGGAAAGAAAAACATTTTGCTGAAAGAGAA
TAGTTTTTATAATTGTTTGTGTTTTTTTATGCACATTTAA
CCCCTTGTTTGTCATTTTTCATTATGCATTGCATTAAAAA
TGGTCATTGATGTAAATTAAACATGAATTTTCATACTGTA
AGACAGTATTTATCATCATGCCCACATTTTTATTAATATC
TGCATAAATTGAATATTAATAACAAATGACTTTGAACAAT
AAATAAGCGATGATTTATATTATATATATTTTAATTACTC
CAAAGTCATTTAAATTCACTGTAATTAGATTTTGTGTGTG
TGTGTGTGGAATTAGCATGTTGTGGGAAAATAATTTGAAT
AAATAATGCATATTTAGAATATTAATTAAAATTTTAATTG
GATATATAAATTAATGCAACTTGCAATTATTTAAATGTTG
CTATGTTGGGGCGATGACCATTTCTGAGATTTCCCACAGA
TTTTTTTAGCGTGTTCATGCTCTGACCATTTTCTGTGCAT
TAGAGATTGAGTATTCAGCTCCTGTAGTTTACATTAATCA
GCTTACTCTGACGTTTACAGTTCAGTACTCCAGTGTAAGA
ACCATATTTAAACTGAAAATAAAAACAAGGCTGTGTCACT
TTATTTTGTCCAATCACAGCAGTTGTTATCCCTAAGCCCC
TCCTATCAGCTTCTGGATGAGCATGTGTGCGTGGTGAAAT
GGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGA
AACGTCTTTATTTTTATTTCATTATATTTTAATTTCATGC
GATGCACACAAGCTCATATCCTGGCAGCGTTTTCTGCGAG
CACAACAGTGTCTTGTTTCTAATACTGTACCCAACTCTGC
TCAGCCACTCTTGTCTTGCAAAGGAAAACAAATGCACTTG
TTATTTACACAGCAGATCTGGTGACATATGCACTTAAATC
AGACTGTACACTCCATCTAACACTATAACTGATGAATCGT
TTGAAGACACTCACATCCCCTCATAATCAACACTAGAGCG
TGTCGAGGAAACGAGTGCACTTGTTTCAGATGAGTGAGTG
GTTTGAATAGAGGGGACGGCACACTTTATTGATGACTAGT
GGGTGTGGCTTGTATCTGGCCCCTCCTCTCTCTTGGATCT
GTGGGCGGGGCTTACAGTGGGCACTGTATTGTATCTGCTA
AACGGACTGTGGAAGGTAAATTTTGCTGTATACGAGTTGT
CTGTATATGTCTGCTTACTGTTTGCACATCATAAAATGTC
AGACGTT

OTTDART00000051061 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000051061|OTTDARG00000035835|ZDB-GENE-050417-401 atg16l1|OTTDARP00000040133 atg16l1-001 LG_none CU929115.5,CU672237.6 Danio rerio protein_coding KNOWN, 4727 bp
TAGAGCCAAAATGGCGTCCGTGATCCTTCAGTCTGGTGTG
GGCTAGCATGAAACCTACCCGATTTACCCTGAAATGACAC
ATTTCTGCTGTTATTAGTCGGATTACTCAATTCTATCATC
AAAAAGAATCGGCGTTATCCTCAAGAGGACGCGTTTTGAT
GCTGTGAGGAGGAGATGGCGGGACGCAGAGTGGAGTGTTT
GTGGAAGCGTCACGTTGTGGAGCAGCTGAAGCAGAGAGAC
AGAGTACAGCGTCAGGCCTTTGAGGAGATCATACACCAAT
ATAACCGGCTGTTGGAGAAGTCTGATCTTCAGGTTGTTTT
TTCTGAACGTCTCCAAACTGAGAAATATGAGCAACAGAAC
AGACACGACCTCAGTCCGTGTGTGGACGGCGGGCGCAGTG
ATTCTCTGCAGCAGGAAATGTCTCAGATGCGGATCAGACA
TCAGGAAGAGCTGACGGAGCTCCACAAGAAAAGAGGAGAG
CTGGCCCAGAGTGTGATTGAATTAAACAACCAGATCCAGC
AGAAAGACAAAGAGATCCAGAGTAACGAAGTCAAGATGCA
GGAGTATCTGCAGCAGATCTCGCAGCTGGAAGGAGAGTGT
CGTGAGCTCAGGAACTGTCTGGCGGATTTGGAACGAGCCA
ATCAGACGCTGCGAGACGAGTACGACGCCCTGCAGATCAC
GTTCAGCGCTCTGGAGGAGAAACTGCGCAAAACCACCGAG
GACAATCAGGAGCTGGTGACGCGCTGGATGGCGGAGAAAG
CCCAGGAGGCCAACAGACTCAATGCTGAGAACGAGAAGGA
CTCCAGACGCAGGCAGGCAAAGCTGCAGAAGGAACTGGCA
GATGCAGCAAAGGAGCCGCTTCCTATCGACCCAGATGATG
ACATCGAGGTTCTCACAGAGGATGCTGGGAAGGCAACGGG
TGAAACGTCACCGAGCAGACAGCTCAGTCGCACACCCAGT
AAACGGTTGTCTCAGCCCCCTCCTCCCGCAGGACTGCTGG
ACTCCATCTCTAATATGTTTGGAAGACGTCGCTCCGTGAA
TTCGTTCAGCTCGTCTCCTGAAAACGCAGAAGTGCCGTCG
GCGTGTGCGGATGTGCGTGTTCCCTCCACTGCACTCCACA
TCTTTGACGCTCATGATGGAGAAGTGAACGCTGTGAGGTT
TAGTCCTGGTTCTCGTCTGCTCGCCACAGGAGGAATGGAC
CGCCGGGTCAAACTCTGGGAAGTCGTATCTGGGCGATGTG
AACCTAAAGGTGCACTGACGGGAAGTAATGCTGGAATCAC
CAGTATAGAGTTTGACAGTGCGGGCTCGTATCTTCTGGCT
GCTTCCAATGATTTCGCAAGCCGAATTTGGACTGTCGATG
ACTACAGACTGAGGCACACGCTCACAGGACACAGCGGGAA
GGTTTTATCTGCTCGCTTTCTCCTGGATAACGCAAGGATC
GTTTCCGGCAGCTACGACCGAACGCTCAAACTCTGGGACC
TGCGCAGCAAAGTCTGCATGAAGACGGTGTTTGCTGGTTC
CAGCTGTAATGATATCGTCTGCACGGAGCAGTGTGTGATG
AGCGGACACTTCGATAAGAAAGTTCGCTTCTGGGACATCA
GGGCAGAGAGTATCGTGCGTGAGCTGGAGCTGATGGGCCG
TGTGACGTCTCTGGATCTGAATCACGACCGCACTGAACTC
CTCACCTGCTCTCGGGATGACCTGGTGAAAATCATCGACC
TGCGCACTAATGCTGTCCGACAAACCTTTAATGCTCAAGG
CTTCAAGTGCGGTTCTGACTTCACCAGGGTCACGTTTAGT
CCTGACGGGAGTTTTGTGGCGGCCGGTTCTGCAGACGGCG
TTCTGTACCTCTGGAACGTTCTGACAGGGAAACTAGAGAA
AACCCTCGATAAGGGTCACAGTTCTGCTATCAACTCGGTG
TCCTGGTCTCTGTCGGGAGCGTTTGTGGCCAGTGTGGAGA
AAGGCAGCAAGGCCGTGCTTTGGTCCGACATGTGATCCTC
CGCCGTGATTGGCTAAACATGGCACCGCCCTGCCGTGATT
GGATGAAACAGACTGTAAAGACGGAACGAAAGTGAGCCCA
CCCTCACGCCCCACAGGCCTCTAAAACTACCTTTCCCACA
ATGCCATCTGTCTGGCTCTCTACACATACTATACTATACA
TATTTATAGCAGCTTTCATGCACAGTCTCGTGTCTCACAC
ACACACACACACACACACACACATGCATTCAGTGCGAGAT
TACACAAAAGACTCTCGTTGATCTTTGACTCTTACTGCTT
ATTTTAACACAGCTTTAAATCAGTGTGTGTGTGTTTACTG
TTGTAGTTCATGCTTTGCCTTATACAGATACAGGCCATTA
AGGTGTGTGTGTGTGTGTACGTTTGTGTGCGTGCGTTTGC
GAGTGCGTGCGTGCATGAGTGCATTTGCGTTGGTATGTGC
GTGCGTTTGCGAACGTCGTTGCGTTTGTGTGCGTGCATTT
GTGTATGCGCGCACGTTTGCATGCGTGCATCTGAGTGCGT
GTGTTTGCGTACGTTTATGCGTGTGTGCATTTGCGCGTGT
GTATGTGCGTTTGCGTGCGTGAGTGCGTTTGCGTACGTGC
GTGTTTGTGTGCTCGTGTTTGCATGCAGACACGAGCACAC
AAACACATGCATGTGCGTTTGCGTATGTATGTGCGTGTGT
TTACGTACATGTGTGCGTTTGCTTACGTGCGTTTACGTAC
ATATGTGCATTTGTTTCCATACATGCGTGTTTGTGTGTGC
GTTCGTGTACGTGCATGTGTTTGAGTGTGTGCATTTACGT
ACGTGTGTGCGTGCTTTTGCGCATGTGTTTGTGCGTGCGT
TTGCATACGTATGTGCGTGTGTTTACGTACATGTGTGCGT
TTGCTTACGTGCGTTTACGTACATATGTGCATTTGTTTCC
ATACATGCGTGTTTGTGTGTGCGTTCGTGTACGTGCATGT
GTTTGAGTGCGTGCATTTGCGTACGTGCGTGTGTGCGTTT
GCGTACGTGCGTGTGTTTGTGTGCGTGCGTGTGTTTGTGT
GCGTGCGTGCGTTTGTGTACGTGTGTGCGTTTGCATACGT
GCGCGTGTTTGCGTACGTTCGTTTATGTGCATCTCTGTGT
GCGTTTGTGTGCGCGTGCATTTGCTTGTGTGCATGCATTT
GTGTGCTCGTGTGTCTGTGTGTGTGCGTGTGTGTATGTTC
ATTAAAGTAATTCCAGCATTGTTAACACAAAATAATGTCA
GGTTGCTGAAAATCGTCCTGTTAAGGGTTAAAAAGTATCC
CAATTGTCTATAGCAACTTACATTTGCTCGGAAAGGATCT
TAAAAATCAAAGGAAAGAAAAACATTTTGCTGAAAGAGAA
TAGTTTTTATAATTGTTTGTGTTTTTTTATGCACATTTAA
CCCCTTGTTTGTCATTTTTCATTATGCATTGCATTAAAAA
TGGTCATTGATGTAAATTAAACATGAATTTTCATACTGTA
AGACAGTATTTATCATCATGCCCACATTTTTATTAATATC
TGCATAAATTGAATATTAATAACAAATGACTTTGAACAAT
AAATAAGCGATGATTTATATTATATATATTTTAATTACTC
CAAAGTCATTTAAATTCACTGTAATTAGATTTTGTGTGTG
TGTGTGTGGAATTAGCATGTTGTGGGAAAATAATTTGAAT
AAATAATGCATATTTAGAATATTAATTAAAATTTTAATTG
GATATATAAATTAATGCAACTTGCAATTATTTAAATGTTG
CTATGTTGGGGCGATGACCATTTCTGAGATTTCCCACAGA
TTTTTTTAGCGTGTTCATGCTCTGACCATTTTCTGTGCAT
TAGAGATTGAGTATTCAGCTCCTGTAGTTTACATTAATCA
GCTTACTCTGACGTTTACAGTTCAGTACTCCAGTGTAAGA
ACCATATTTAAACTGAAAATAAAAACAAGGCTGTGTCACT
TTATTTTGTCCAATCACAGCAGTTGTTATCCCTAAGCCCC
TCCTATCAGCTTCTGGATGAGCATGTGTGCGTGGTGAAAT
GGTGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGA
AACGTCTTTATTTTTATTTCATTATATTTTAATTTCATGC
GATGCACACAAGCTCATATCCTGGCAGCGTTTTCTGCGAG
CACAACAGTGTCTTGTTTCTAATACTGTACCCAACTCTGC
TCAGCCACTCTTGTCTTGCAAAGGAAAACAAATGCACTTG
TTATTTACACAGCAGATCTGGTGACATATGCACTTAAATC
AGACTGTACACTCCATCTAACACTATAACTGATGAATCGT
TTGAAGACACTCACATCCCCTCATAATCAACACTAGAGCG
TGTCGAGGAAACGAGTGCACTTGTTTCAGATGAGTGAGTG
GTTTGAATAGAGGGGACGGCACACTTTATTGATGACTAGT
GGGTGTGGCTTGTATCTGGCCCCTCCTCTCTCTTGGATCT
GTGGGCGGGGCTTACAGTGGGCACTGTATTGTATCTGCTA
AACGGACTGTGGAAGGTAAATTTTGCTGTATACGAGTTGT
CTGTATATGTCTGCTTACTGTTTGCACATCATAAAATGTC
AGACGTT

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations