ZFIN Feature: pd298

Notes

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Variants

Variant Type: Small Deletion
Variant Location: Chr 6: 39392471 - 39398235 (GRCz11) (1) Details
Nucleotide change: GGTTTCGGCCTTTCTCCTTGCGGCCCTTGCCTTCGTTGTTGTCGTCCTGCTTTTCCTTCT CGGGCTTGGTTACACTGTCATAGGATGGCAGGGATGCAGTGGAAGGTGTGCCCTCTTTCT TCTCCTGATTGCCCCCACCGTTCTCCAGTTTGTTGTTGGCAGGCCTGCGTTTGCAGATGA AGCCCCTGCTCGCGAGGTGGGACCGGTAAGATCTCTGGATCACGATGGCTGACACCTCTT CCTGCTTACGCCGTAGTGTGGTGGTGATGGGCTCATATGACACCTTGGACGGGTTGGCTG CCACAAAGCGCTCCTCCATTTGCTGTCGCATCATGTCCAGGTCACCGCTGTCACCCAGCA CGCGCTTGGTAAAGGCAAACAGAATGTCCAAGCAATGAATGCGGTCGCCGCTCACCATGG GCAGGTCCATGGCGATCAGCTCGATGATGTTTGGCTTTGGCACACGGAGGGGATGCTCTA ATGTATCCGCAAAGTCTGGCAGCTTGGCGAAGGTGATGAACTGGGAAGCGTCGGGGTCAA ACTTTTCCCAGATTTCATAGAAGGACTCAAAGTCGTCTTCGCACAGTGGATCCGCACTCT CTTCGGTGGCAACGCTGAAGTTCTCCAAGATGATAGCGATGTACATGTTCACCACAATCA GGAAAGACACGATAATGTACATTACAAAGAAGAAGATTCCCACTGAAGGATTGCCACAGT TGCCCTTAACTGTGGTTCCTGGGTTCTCTTTATTAGGGTCGCAGTCAGGCGGATAGTTCA AGATAGGAGCCAACAGGCCATCCCAGCCAGCTGATGTGGTGATCATGAATAGACAGATCA TGCTGTTGCCAAAGGTTTCAAAGTTATACATGTCGTCAATTCCTATTTCTCTCTTCACGT AGGCAAAGTTGGACATGCCAAAGATAGAGAAGATGAACATGACTAGGAAAAGCAATAAGC 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Variant Notes: 6:39392471-39398235 (GRCz11) , deletion of exons 22-27
Zebrafish Nomenclature Committee

Effect on DNA/cDNA, transcript, protein (from publications)

DNA/cDNA Change: None
Transcript Consequence: None
Protein Consequence: None

Sequences

Flanking Sequence: TTTTCTGCATGGAAAGTTCGCCGACGCAGTTCAGAAGCATGGGATTCCATCCTGGTTTTCCCTTGGAGATTATCACATTCCTGCTCGGTGAAGAGTTCCATACTGAAGCGCAATATAGCCCTCTAAAATACACTTGATCAAGTATCGGTCTTTTTAAATTCGTATTTGATACTGTTTTAATCAAGTCTTGATGCAACAGTGTCACACAGGAAGCTGATTATGTTTGGTTTAACTTGTAAGAGTCTTCAAGCTTTGAGGAACCCCAACACTTTTCGCCGCCTCGATACGCCAGTGACGTTTGTAAACAATTTTTTGTCGTGTTACTTCGGCTTTGTTTTTTCCCCTTAAATGAAATTAATCTGTACATCTGTATAAGTTAATTCAGGGTTTCCATTCGCTTGAAATGACAGTTTTTTGTTATAAATATCGGCATGATCATTATCACTGTCCATGAGTGTTACCGCAGCAGTCTTAACACTTAGATTCCCTGACATCTTTTT
GGTTTCGGCCTTTCTCCTTGCGGCCCTTGCCTTCGTTGTTGTCGTCCTGCTTTTCCTTCT CGGGCTTGGTTACACTGTCATAGGATGGCAGGGATGCAGTGGAAGGTGTGCCCTCTTTCT TCTCCTGATTGCCCCCACCGTTCTCCAGTTTGTTGTTGGCAGGCCTGCGTTTGCAGATGA AGCCCCTGCTCGCGAGGTGGGACCGGTAAGATCTCTGGATCACGATGGCTGACACCTCTT CCTGCTTACGCCGTAGTGTGGTGGTGATGGGCTCATATGACACCTTGGACGGGTTGGCTG CCACAAAGCGCTCCTCCATTTGCTGTCGCATCATGTCCAGGTCACCGCTGTCACCCAGCA CGCGCTTGGTAAAGGCAAACAGAATGTCCAAGCAATGAATGCGGTCGCCGCTCACCATGG GCAGGTCCATGGCGATCAGCTCGATGATGTTTGGCTTTGGCACACGGAGGGGATGCTCTA ATGTATCCGCAAAGTCTGGCAGCTTGGCGAAGGTGATGAACTGGGAAGCGTCGGGGTCAA ACTTTTCCCAGATTTCATAGAAGGACTCAAAGTCGTCTTCGCACAGTGGATCCGCACTCT CTTCGGTGGCAACGCTGAAGTTCTCCAAGATGATAGCGATGTACATGTTCACCACAATCA GGAAAGACACGATAATGTACATTACAAAGAAGAAGATTCCCACTGAAGGATTGCCACAGT TGCCCTTAACTGTGGTTCCTGGGTTCTCTTTATTAGGGTCGCAGTCAGGCGGATAGTTCA AGATAGGAGCCAACAGGCCATCCCAGCCAGCTGATGTGGTGATCATGAATAGACAGATCA TGCTGTTGCCAAAGGTTTCAAAGTTATACATGTCGTCAATTCCTATTTCTCTCTTCACGT AGGCAAAGTTGGACATGCCAAAGATAGAGAAGATGAACATGACTAGGAAAAGCAATAAGC 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AAAAACAACAACAGAATCGGGGGAAGTGGGCAAGAAAAGACAGAAAAAGTATTAGAGTAATGTACCAAAACTGAGCTATT ...
Additional Sequence: None

Fish

Supplemental Information

Genotyping protocol: None

Citations