Transcript

rom1a-201

ID
ZDB-TSCRIPT-090929-6143
Name
rom1a-201 Nomenclature History
Previous Names
  • rom1a-001
  • zgc:73336-001
Transcript Type
mRNA
Annotation Status
Annotation Method
Ensembl
Associated With Genes
Strain
TU
Non Reference Strain
Genome Resources
RNA Central
None
Note
None
Sequence
ENSDART00000011295 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|ENSDART00000011295.9|gene_biotype:protein_coding|ENSDARG00000019752.9 transcript_biotype:protein_coding gene_symbol:rom1a cdna chromosome:GRCz11:5:67126774:67145505:-1
GGAGGTGCAAGGGCACTGAGTGGGCATCTCGGGGGGGATC
ACCACACAAAACATCCGGTCTGACCTTTGCTAACGGATTA
ATTGACGACGGCATACAGAATAGCGGCTGAATTGTTTGGA
TAAAACTGAATTTATTGAACAACTGAAGGATTACACCGAG
TACTTATCTACTTTTTTATTTTATTTCTGCAGCTTCAGCT
CAATTCGCGGGAACTTCTCATTTTTAATAGCTTATTTTCA
ACACTTCCTTTTTTTCGGTCAAGTTTACTCCATTATAATC
TATCACAATGGTCGTGGGTAAGATGAAGTTCACGTTTCAG
AAAAGGGTGAAGTTGGCCCAGGGTTTATGGATGCTGTCGT
GGTTGGCGACGGTTGGTGGAGCGATCACCTTCACTTTAGG
ATGCTTCCTAAAGACTGAGCTACGAAGGAGGGGAGAGGTA
ATGGACAACACAGACATCCATTGTGTGCCCAACACCTTGA
TGATTGTTGGTCTGGCTTCGATGGGCGGCAATTACTTTGC
CAGTCGAATCTGCCAGGATGCCCTGGATGCCGGGCGTTTC
CCACGGTGGAAGACCTACATGAAGCCTTTTTTTGGCTGCT
CCATTTTCTTCACCACCCTCATGTTGATTTCAATCATCTT
GAGTTACATCATGAAGGGCAGCCTGGAGACCTCGCTGAAA
ATCGGCCTGAAGAACGGCATCCGCTTCTACAAGGACACCG
ATATCCCTGGCCGCTGCTTCCAAAAGCAGACCATCGACCG
GCTTCAGATGGAGTTCCACTGCTGCGGAAACACAGACTAC
AGGGATTGGTTCGAGGTGCAGTGGATCAGCAACCGCTACC
TGGATTTCAGCTCTAAGGAAGTTAAGGACCGCATTAGGAG
CAATGTCGACGGCCGCTATTTGGTGGACGGTGTGCCCTTC
AGCTGCTGTAACCCCAGCTCTCCCAGACCCTGCATTCAGT
ACAAAATCACCAACGACTCTGCCCACTACAACTACGAGCA
CGAGACGGAGGAGCTCAACCTCTTCATCCACGGCTGCAGG
GAAGCTCTGGTCAACTACTTCATGGGGCTGATGAACACCA
TTGGAGCCGTCGTTCTGTCCGTCTTTCTCATTCAGTGCTC
GGTGTTGTCTAGCGTGCGCCTCCTGCAAACATCCATGGAA
GCGGTAGCCGGACAGGAGAACGTGGAGATCGACACTGAAG
GCTACTTGCTGGAGAAAGCCTTGAAGGAGACCATCATGGA
GTACGTGGATCCTGTGATGAAGCTCCTTTTGCTGAATCAA
GTCGGATCTTCTGAAGATAAAGCAGAAGCAGGAGCCGCAA
CCAGCTAAAACCATCTTCATCCCACATCTGAAACCTTTCC
AGCTGGAGGCTGAGAGTGCTGACAAATCGTCATCAATCCA
ATAATACATTCATTTCTTTTCATTCGGGTTAAGGCTGGTT
TATAGTTCTGCGTCAGGCGTACGTTGTGCTCTAGCGCAGC
CTTCACGCGGTCGCAGACCCCTTGCCGTGGCCGACACTGA
TGCACAGCTCTTGAAAATTGTAACTACATGTCGTAATGGC
ACGTAGCGCAAGCTCTGTGATTGGTTGGCTTGGTAGCAGT
GACATGTGTGGGCGGTGCTAAGAGCCACTTGATCCCAATG
GAGTGAGTGTTTACAAGTGTTGAGTCCTGTGTTTACCTCA
TAATTAAAGACGTTGGACGTCCGCCGGTTCCCACTTCTGA
ATAAGCAAGTTTTAGCTACTTGTACATTAAGGTAGCGTTC
AGATAAAACAAAACACCAGCGAAGAAACTCGACACAGAGA
AACATAAAAGCCTCCTGCCAGCTAGCACTTGGGAAGAGTT
ATTGCAGAGCAACACAAACAGCATGCAGAAGTATAAATGC
ACGACGCGCAAGGCAGGCGCTATGGGTCACGGCGATCACT
TGACACAGAAGCATAAATCAGCCTTTAGTCCTTTGTTTAT
GAGGGGTCACCACAGCGGAATGAACCACCAATTCAATAAT
TCATCTATTGGTATTTACAAATCTCCACTCAATGACTGAA
ATGAATGAATGGTAACACTTTACTTGTAGGGGCGTTTATA
AGACTGTCGAGAAACCTTTATAATCATAATATGACACGTT
GTGAATGAGATTTTTTGCTTGCTTACGACAACTATTTAGT
GTCATTTGCTCATTTTAAATGCAAAGATGACATTGTTTGC
TATGGTAACTTGACTCTCACTACCAGTCTTCATCTTTGTC
GGTAATTTGACATTACCAAGACAACTTAACTTGTCATAAA
TCTGTCACAAGATTGCCATAAGGACATTATAATTGTGTCA
TGTGATCACATTTTCAGTGGAACAAACTGTATTTGTCATT
GAAATGTCTCAAGTGTCATTACTCTGTCAAATCATTTTTA
ACAGCGTCATTAATATTTAATGACATTTTAATTACAAATT
TGGCTTGAACTGCTGTAATTGAGGTTATATATATACTTTA
CTAGCAAGACGTCTCTTCCTTTTAAAGTGGAAACACGTCT
CTCCACCCTCTTGATGCATGGATAAAAGAAGTGTTTACTT
GCATTAGATTGAAAACGGTTATACTATCACTTACTGGCTT
TTTAAAGACCTTTGACAAGGTGTGGCGCCCTTTTTTTAGA
TTATTTGCTGGCTAACTCTCTTGATTATTAAGCTGAGCAA
TAATATATAAATACATACTGAATTTATAAGTTTTTTTTCC
TTTCTTTTTTCCTTTCCCCTTTAAAAATTTTTATTTTAAT
TATCTTTTTACTCATTAATTATGTTTTAGCTTTTCAATGG
GAGGTTATGGACTGTTGAGGGAGGGTAATGTTAAATTGGG
GTCGTGTTAGCACCAACATGGAAGGATAATTATAAAATGA
ATGTTGTAATTGATAATCCATGTAGAAAACATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATAATGCTGTTATA
AAATTCATGACATGCCTATAATGGCTTCTTGACAATCATG
TTTATGACAGATTTATGACAGGCTTTGTTGTCTTGGTAAT
GTCAAGTTGTCATGACAAAGACAAAAACAGGTTGTGACGT
ATTTGTTTATGTCAAATTGTCATAACAAACGATGTCATCT
TTGCATTTAAAATGTTTTAAAGGGAATGACACTTAATGAC
AGTTGTTATAAGCATGCATAAAATCTCATTCACATTCATG
TGTCATGATTTTAAAGGTTTGGTCTTTTGAACACCCCTTC
AAGCAAAGTACTACCAAATAAATTTACAAACCCTAGCATT
TTACCCGATTTCATTATTATTATTATAATATTTTAAAACA
AAATCTGTCAATCTCTTCAGCATTTATGATTAAATATGTG
ATATTGCTTACCTTCGGGTGAGTAAACAAACGCTCAAACC
TGTGAGGAGAAACTTGGAAATGATTAGCAACATGACTTTA
CAACATACCTGCTCCTGTTTTTTTCCTGGGAGTCTCCCGT
GTGTCAGACCTATCTCCCACCACCCTCCCGTTTTGTTATT
TCTCATGGAAAACTCCTGTAATTTTAATTCCTCAGGTTTT
TGGTACAGTCTATAACACCCCCAGGTCTTTGACATTGGTA
TAGTTTCCAATCGCAGCGGCTGCCCGAAACCCGGTGCATA
GTTACTTAGCTGTGTCATTCAGACACTTCACCCCCGACAC
TTAGACATCCCCACCACTCCCCCTCTCGGTCTCCCAGATT
TTCAGAGACAAATGTTGGCAGGTATGCTCGACAAGTGGGT
CAAAAGGATTGCATTTAATATATATTTTAGCTACAGATAG
TTTCTATTTAATTGGAAATAACATTCTTACTATCAAGTGT
TTAAAATATTCACTTGCACACTTTTTTCCTTGATACAGAA
AGTATAAGTATGCACTCCTTTTTGCAACATAGGCTCATTC
TGAAAACGTAGGCCTATCAACGTTTCTGAAGATCGCGAAT
TATATAGCCAGAAGTACGTATGGCTGCATTTCATTTTTAA
AACGAACGCTACGGAGCTGTATGATGCCGTTTTTTTTCGC
ATTTACTAGCTGACTGCTTACCTCCATATGGACGGCATTC
CAGCTGTTACCAGTTTGTCTGGTTAGCTCACCATATATGT
CGGTGGGCGGGTCAATCTGTGCTTTTAAAAATTCTATTGG
TTGGGTTTAGGGAAGGAGGAGGGTGGGTCAGTCGATCAGT
CAGTCATTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAAC
AGTGGCTCTTGGTGGATTTACATGAGAACAGCAGGCACGA
ATGGCACTCGAGAGAGAAATTTGAGATCTCAACAAGCATA
CACAGCGGCCTCTGGTGGATTCAAGAAAACAAAAACTGCA
AAAAACAAAAACGTAGCTCCAGGGACAAATTTGGCGCTCT
CCAGAAATGTATACAGAGGTACGCTTTCAGAATGAGTCTG
GGTTGCCTTTTTCACAAGTGTAAAATCTGAAATCTACACA
GTCATGATAAAATTAGTTCAAACCATCCTCAATCTTTAAG
AATTCTGTAATTTCAATAAAAGTAATTATAATAAAAATCA
ATCAGAAGTATTACAATTTCATAGTTTTCTCCAAGCATTA
ATTTTCTCACTCAGCGTTAAATGCCTATTGTAAACATAAA
TACGTACCTGTCATTAAGTCATCTTTGTTTTGCATTCAGC
ATGGAATTAAATGCATTGTAAGTGTTAAAAGAGGGTGTAG
ATGATGCTCAATGCTCTGCTATGAAACACTGTACTCGCAG
AAATCTGTCAGTTCTAATAAAATCTGACATTTTGAA

OTTDART00000022918 (1) [ Show ] (double-click sequence to select) [Download]
>tpe|OTTDART00000022918|OTTDARG00000018799|ZDB-GENE-040426-1765 rom1a|OTTDARP00000019116 DKEY-273O13.4-001 LG_ BX897741.9 Danio rerio protein_coding KNOWN, 4796 bp
GGAGGTGCAAGGGCACTGAGTGGGCATCTCGGGGGGGATC
ACCACACAAAACATCCGGTCTGACCTTTGCTAACGGATTA
ATTGACGACGGCATACAGAATAGCGGCTGAATTGTTTGGA
TAAAACTGAATTTATTGAACAACTGAAGGATTACACCGAG
TACTTATCTACTTTTTTATTTTATTTCTGCAGCTTCAGCT
CAATTCGCGGGAACTTCTCATTTTTAATAGCTTATTTTCA
ACACTTCCTTTTTTTCGGTCAAGTTTACTCCATTATAATC
TATCACAATGGTCGTGGGTAAGATGAAGTTCACGTTTCAG
AAAAGGGTGAAGTTGGCCCAGGGTTTATGGATGCTGTCGT
GGTTGGCGACGGTTGGTGGAGCGATCACCTTCACTTTAGG
ATGCTTCCTAAAGACTGAGCTACGAAGGAGGGGAGAGGTA
ATGGACAACACAGACATCCATTGTGTGCCCAACACCTTGA
TGATTGTTGGTCTGGCTTCGATGGGCGGCAATTACTTTGC
CAGTCGAATCTGCCAGGATGCCCTGGATGCCGGGCGTTTC
CCACGGTGGAAGACCTACATGAAGCCTTTTTTTGGCTGCT
CCATTTTCTTCACCACCCTCATGTTGATTTCAATCATCTT
GAGTTACATCATGAAGGGCAGCCTGGAGACCTCGCTGAAA
ATCGGCCTGAAGAACGGCATCCGCTTCTACAAGGACACCG
ATATCCCTGGCCGCTGCTTCCAAAAGCAGACCATCGACCG
GCTTCAGATGGAGTTCCACTGCTGCGGAAACACAGACTAC
AGGGATTGGTTCGAGGTGCAGTGGATCAGCAACCGCTACC
TGGATTTCAGCTCTAAGGAAGTTAAGGACCGCATTAGGAG
CAATGTCGACGGCCGCTATTTGGTGGACGGTGTGCCCTTC
AGCTGCTGTAACCCCAGCTCTCCCAGACCCTGCATTCAGT
ACAAAATCACCAACGACTCTGCCCACTACAACTACGAGCA
CGAGACGGAGGAGCTCAACCTCTTCATCCACGGCTGCAGG
GAAGCTCTGGTCAACTACTTCATGGGGCTGATGAACACCA
TTGGAGCCGTCGTTCTGTCCGTCTTTCTCATTCAGTGCTC
GGTGTTGTCTAGCGTGCGCCTCCTGCAAACATCCATGGAA
GCGGTAGCCGGACAGGAGAACGTGGAGATCGACACTGAAG
GCTACTTGCTGGAGAAAGCCTTGAAGGAGACCATCATGGA
GTACGTGGATCCTGTGATGAAGCTCCTTTTGCTGAATCAA
GTCGGATCTTCTGAAGATAAAGCAGAAGCAGGAGCCGCAA
CCAGCTAAAACCATCTTCATCCCACATCTGAAACCTTTCC
AGCTGGAGGCTGAGAGTGCTGACAAATCGTCATCAATCCA
ATAATACATTCATTTCTTTTCATTCGGGTTAAGGCTGGTT
TATAGTTCTGCGTCAGGCGTACGTTGTGCTCTAGCGCAGC
CTTCACGCGGTCGCAGACCCCTTGCCGTGGCCGACACTGA
TGCACAGCTCTTGAAAATTGTAACTACATGTCGTAATGGC
ACGTAGCGCAAGCTCTGTGATTGGTTGGCTTGGTAGCAGT
GACATGTGTGGGCGGTGCTAAGAGCCACTTGATCCCAATG
GAGTGAGTGTTTACAAGTGTTGAGTCCTGTGTTTACCTCA
TAATTAAAGACGTTGGACGTCCGCCGGTTCCCACTTCTGA
ATAAGCAAGTTTTAGCTACTTGTACATTAAGGTAGCGTTC
AGATAAAACAAAACACCAGCGAAGAAACTCGACACAGAGA
AACATAAAAGCCTCCTGCCAGCTAGCACTTGGGAAGAGTT
ATTGCAGAGCAACACAAACAGCATGCAGAAGTATAAATGC
ACGACGCGCAAGGCAGGCGCTATGGGTCACGGCGATCACT
TGACACAGAAGCATAAATCAGCCTTTAGTCCTTTGTTTAT
GAGGGGTCACCACAGCGGAATGAACCACCAATTCAATAAT
TCATCTATTGGTATTTACAAATCTCCACTCAATGACTGAA
ATGAATGAATGGTAACACTTTACTTGTAGGGGCGTTTATA
AGACTGTCGAGAAACCTTTATAATCATAATATGACACGTT
GTGAATGAGATTTTTTGCTTGCTTACGACAACTATTTAGT
GTCATTTGCTCATTTTAAATGCAAAGATGACATTGTTTGC
TATGGTAACTTGACTCTCACTACCAGTCTTCATCTTTGTC
GGTAATTTGACATTACCAAGACAACTTAACTTGTCATAAA
TCTGTCACAAGATTGCCATAAGGACATTATAATTGTGTCA
TGTGATCACATTTTCAGTGGAACAAACTGTATTTGTCATT
GAAATGTCTCAAGTGTCATTACTCTGTCAAATCATTTTTA
ACAGCGTCATTAATATTTAATGACATTTTAATTACAAATT
TGGCTTGAACTGCTGTAATTGAGGTTATATATATACTTTA
CTAGCAAGACGTCTCTTCCTTTTAAAGTGGAAACACGTCT
CTCCACCCTCTTGATGCATGGATAAAAGAAGTGTTTACTT
GCATTAGATTGAAAACGGTTATACTATCACTTACTGGCTT
TTTAAAGACCTTTGACAAGGTGTGGCGCCCTTTTTTTAGA
TTATTTGCTGGCTAACTCTCTTGATTATTAAGCTGAGCAA
TAATATATAAATACATACTGAATTTATAAGTTTTTTTTCC
TTTCTTTTTTCCTTTCCCCTTTAAAAATTTTTATTTTAAT
TATCTTTTTACTCATTAATTATGTTTTAGCTTTTCAATGG
GAGGTTATGGACTGTTGAGGGAGGGTAATGTTAAATTGGG
GTCGTGTTAGCACCAACATGGAAGGATAATTATAAAATGA
ATGTTGTAATTGATAATCCATGTAGAAAACATATATATAT
ATATATATATATATATATATATATATATAATGCTGTTATA
AAATTCATGACATGCCTATAATGGCTTCTTGACAATCATG
TTTATGACAGATTTATGACAGGCTTTGTTGTCTTGGTAAT
GTCAAGTTGTCATGACAAAGACAAAAACAGGTTGTGACGT
ATTTGTTTATGTCAAATTGTCATAACAAACGATGTCATCT
TTGCATTTAAAATGTTTTAAAGGGAATGACACTTAATGAC
AGTTGTTATAAGCATGCATAAAATCTCATTCACATTCATG
TGTCATGATTTTAAAGGTTTGGTCTTTTGAACACCCCTTC
AAGCAAAGTACTACCAAATAAATTTACAAACCCTAGCATT
TTACCCGATTTCATTATTATTATTATAATATTTTAAAACA
AAATCTGTCAATCTCTTCAGCATTTATGATTAAATATGTG
ATATTGCTTACCTTCGGGTGAGTAAACAAACGCTCAAACC
TGTGAGGAGAAACTTGGAAATGATTAGCAACATGACTTTA
CAACATACCTGCTCCTGTTTTTTTCCTGGGAGTCTCCCGT
GTGTCAGACCTATCTCCCACCACCCTCCCGTTTTGTTATT
TCTCATGGAAAACTCCTGTAATTTTAATTCCTCAGGTTTT
TGGTACAGTCTATAACACCCCCAGGTCTTTGACATTGGTA
TAGTTTCCAATCGCAGCGGCTGCCCGAAACCCGGTGCATA
GTTACTTAGCTGTGTCATTCAGACACTTCACCCCCGACAC
TTAGACATCCCCACCACTCCCCCTCTCGGTCTCCCAGATT
TTCAGAGACAAATGTTGGCAGGTATGCTCGACAAGTGGGT
CAAAAGGATTGCATTTAATATATATTTTAGCTACAGATAG
TTTCTATTTAATTGGAAATAACATTCTTACTATCAAGTGT
TTAAAATATTCACTTGCACACTTTTTTCCTTGATACAGAA
AGTATAAGTATGCACTCCTTTTTGCAACATAGGCTCATTC
TGAAAACGTAGGCCTATCAACGTTTCTGAAGATCGCGAAT
TATATAGCCAGAAGTACGTATGGCTGCATTTCATTTTTAA
AACGAACGCTACGGAGCTGTATGATGCCGTTTTTTTTCGC
ATTTACTAGCTGACTGCTTACCTCCATATGGACGGCATTC
CAGCTGTTACCAGTTTGTCTGGTTAGCTCACCATATATGT
CGGTGGGCGGGTCAATCTGTGCTTTTAAAAATTCTATTGG
TTGGGTTTAGGGAAGGAGGAGGGTGGGTCAGTCGATCAGT
CAGTCATTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAAC
AGTGGCTCTTGGTGGATTTACATGAGAACAGCAGGCACGA
ATGGCACTCGAGAGAGAAATTTGAGATCTCAACAAGCATA
CACAGCGGCCTCTGGTGGATTCAAGAAAACAAAAACTGCA
AAAAACAAAAACGTAGCTCCAGGGACAAATTTGGCGCTCT
CCAGAAATGTATACAGAGGTACGCTTTCAGAATGAGTCTG
GGTTGCCTTTTTCACAAGTGTAAAATCTGAAATCTACACA
GTCATGATAAAATTAGTTCAAACCATCCTCAATCTTTAAG
AATTCTGTAATTTCAATAAAAGTAATTATAATAAAAATCA
ATCAGAAGTATTACAATTTCATAGTTTTCTCCAAGCATTA
ATTTTCTCACTCAGCGTTAAATGCCTATTGTAAACATAAA
TACGTACCTGTCATTAAGTCATCTTTGTTTTGCATTCAGC
ATGGAATTAAATGCATTGTAAGTGTTAAAAGAGGGTGTAG
ATGATGCTCAATGCTCTGCTATGAAACACTGTACTCGCAG
AAATCTGTCAGTTCTAATAAAATCTGACATTTTGAA

Segment Relationships
Protein Products
No data available
Supporting Sequences
Citations